用红曲酿成的酒称为红曲酒,它具有色泽鲜艳,酒味醇厚的特点。因红曲霉菌能分泌红色素(C23H24O5)及黄色素(C17H24O4)故也常用于腐乳、中药、食品等方面确岩引损家,红曲还具有一定的抗菌防腐能力。其中乌衣红曲是红曲霉、黑曲霉和霉和酵母共生制相要成的曲子。黄衣红曲是红曲霉、细而争黄曲霉和酵母共生而制成的曲。它们耐温抗酸,具损刚较背王有比红曲更强的糖化发酵力。色艳味香的红曲,不仅可用于酿酒,还用于制醋,制腐乳,又可作为天然红色染料,把红曲研成粉末,在烹饪时,着色于鱼肉,菜肴,使色泽鲜艳,味带酒香,是理想的调味品和食用色素,红曲酿酒剩下的红糟还可腌制鱼、肉、蛋、蔬菜等,具有独特风味。
据《本草纲目》载,"红曲有消食祛肿、活血通络、和胃健脾之功效。"从红曲中提取"红曲霉素"对治疗慢性肠炎、痢疾有效。