多样性指数及计算公式如下:(Hill et al., 2眼肉杆广看钱003)
(1).克隆文库覆盖率(C):
n为克隆文库中仅一个序列的OTU数,N为单文移尔库中的OTU数。
(客肥秋处坚2).辛普森指数(D):
1-
N为单个文库中序列右正开极业数,ni为第i种OTU中包含军旧龙季厚湖阻的序列数,n为单文库中序列数。
(3).香农指数(H):
Pi为第i种OTU中序列数在单文库序列总数中的比例,n为单文库中OUT个数。
(4).均匀度指数(E):
H为香农指数,S为单文库中总序列数。
(5).丰富度指数(Schao1):
Sobs为单文库中OTU个数,F1 和F牛害2分别为克隆文库中只包含1个和2个序列的OTU个数。