2022-05-12 01:05:21

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所属类别 :
分子生物学
分子生物学
编辑分类

酶切位点(Restriction Enzyme cutting site):DNA上一段碱基的特定序列,限制性内切酶能够识别出这个序列并在此将DNA序列切成两段。

可能存在同尾酶,不同酶的识别序列不同,有的可能能识别多个酶切位点比如STY1识别序列有WW。

基本信息

  • 中文名称

    酶切位点

  • 外文名称

    Restriction Enzyme cutting site

  • 所属类型

    DNA上一段碱基的特定序列

  • 功能

    将DNA序列切成两段

保护碱基

不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求(在本表中没有列出的酶,则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基,以确保酶切反应的进行。)

寡核苷酸序列

链长

切割率%





2 hr

20 hr

Acc I

GGTCGACC

CGGTCGACCG

CCGGTCGACCGG

8

10

12

0

0

0

0

0

0

Afl III

CACATGTG

CCACATGTGG

CCCACATGTGGG

8

10

12

0

>90

>90

0

>90

>90

Asc I

GGCGCGCC

AGGCGCGCCT

TTGGCGCGCCAA

8

10

12

>90

>90

>90

>90

>90

>90

Ava I

CCCCGGGG

CCCCCGGGGG

TCCCCCGGGGGA

8

10

12

50

>90

>90

>90

>90

>90

BamH I

CGGATCCG

CGGGATCCCG

CGCGGATCCGCG

8

10

12

10

>90

>90

25

>90

>90

Bgl II

CAGATCTG

GAAGATCTTC

GGAAGATCTTCC

8

10

12

0

75

25

0

>90

>90

BssH II

GGCGCGCC

AGGCGCGCCT

TTGGCGCGCCAA

8

10

12

0

0

50

0

0

>90

BstE II

GGGT(A/T)ACCC

9

0

10

BstX I

AACTGCAGAACCAATGCATTGG

AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA

CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT

22

24

27

0

25

25

0

50

>90

Cla I

CATCGATG

GATCGATC

CCATCGATGG

CCCATCGATGGG

8

8

10

12

0

0

>90

50

0

0

>90

50

EcoR I

GGAATTCC

CGGAATTCCG

CCGGAATTCCGG

8

10

12

>90

>90

>90

>90

>90

>90

Hae III

GGGGCCCC

AGCGGCCGCT

TTGCGGCCGCAA

8

10

12

>90

>90

>90

>90

>90

>90

Hind III

CAAGCTTG

CCAAGCTTGG

CCCAAGCTTGGG

8

10

12

0

0

10

0

0

75

Kpn I

GGGTACCC

GGGGTACCCC

CGGGGTACCCCG

8

10

12

0

>90

>90

0

>90

>90

Mlu I

GACGCGTC

CGACGCGTCG

8

10

0

25

0

50

Nco I

CCCATGGG

CATGCCATGGCATG

8

14

0

50

0

75

Nde I

CCATATGG

CCCATATGGG

CGCCATATGGCG

GGGTTTCATATGAAACCC

GGAATTCCATATGGAATTCC

GGGAATTCCATATGGAATTCCC

8

10

12

18

20

22

0

0

0

0

75

75

0

0

0

0

>90

>90

Nhe I

GGCTAGCC

CGGCTAGCCG

CTAGCTAGCTAG

8

10

12

0

10

10

0

25

50

Not I

TTGCGGCCGCAA

ATTTGCGGCCGCTTTA

AAATATGCGGCCGCTATAAA

ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT

AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA

12

16

20

24

28

0

10

10

25

25

0

10

10

90

>90

Nsi I

TGCATGCATGCA

CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT

12

22

10

>90

>90

>90

Pac I

TTAATTAA

GTTAATTAAC

CCTTAATTAAGG

8

10

12

0

0

0

0

25

>90

Pme I

GTTTAAAC

GGTTTAAACC

GGGTTTAAACCC

AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG

8

10

12

24

0

0

0

75

0

25

50

>90

Pst I

GCTGCAGC

TGCACTGCAGTGCA

AACTGCAGAACCAATGCATTGG

AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA

CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT

8

14

22

24

26

0

10

>90

>90

0

0

10

>90

>90

0

Pvu I

CCGATCGG

ATCGATCGAT

TCGCGATCGCGA

8

10

12

0

10

0

0

25

10

Sac I

CGAGCTCG

8

10

10

Sac II

GCCGCGGC

TCCCCGCGGGGA

8

12

0

50

0

>90

Sal I

GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC

GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG

ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA

28

30

32

0

10

10

0

50

75

Sca I

GAGTACTC

AAAAGTACTTTT

8

12

10

75

25

75

Sma I

CCCGGG

CCCCGGGG

CCCCCGGGGG

TCCCCCGGGGGA

6

8

10

12

0

0

10

>90

10

10

50

>90

Spe I

GACTAGTC

GGACTAGTCC

CGGACTAGTCCG

CTAGACTAGTCTAG

8

10

12

14

10

10

0

0

>90

>90

50

50

Sph I

GGCATGCC

CATGCATGCATG

ACATGCATGCATGT

8

12

14

0

0

10

0

25

50

Stu I

AAGGCCTT

GAAGGCCTTC

AAAAGGCCTTTT

8

10

12

>90

>90

>90

>90

>90

>90

Xba I

CTCTAGAG

GCTCTAGAGC

TGCTCTAGAGCA

CTAGTCTAGACTAG

8

10

12

14

0

>90

75

75

0

>90

>90

>90

Xho I

CCTCGAGG

CCCTCGAGGG

CCGCTCGAGCGG

8

10

12

0

10

10

0

25

75

Xma I

CCCCGGGG

CCCCCGGGGG

CCCCCCGGGGGG

TCCCCCCGGGGGGA

8

10

12

14

0

25

50

>90

0

75

>90

>90

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