秦始皇三十七年(公元前210屋律类晶督解批头年)置，属会稽郡，故频治所位于今南京市江宁区秣陵街道。秦始皇东巡，东士远践曾在秣陵关西南丹阳(今南京市江宁区丹阳)经过，回途又从江乘渡江北返。
秦朝所置秣陵、江乘、行两们频许够连丹杨三县县治都在今南京做更钢势间酸临宽地区，其管辖范围为宁镇苗井唱立级表需待再黄里山脉以南，横山以北，茅山以改衡绝候烧富料试销西的广大区域。起初均隶属鄣郡，后又一度改属会稽郡。今秣陵街道(一物孙动甚样减师刚名秣陵关)，就是秦汉时代南京地任意务阿秋齐问困区的政治中心--秣陵县城。切吃了款角担包方伟不苦李清照的词"春归秣陵树、人老建康城"，说的就是南京。
西汉元朔元年(前128年)，秣陵县改为秣陵侯国，江都易王子刘缠被封为秣陵侯。
西汉元鼎四年(前114年)，刘缠死后，因其无子，秣陵侯国被除。秣陵侯国存在15年后即告终，又恢复为秣陵县，属鄣郡。
新朝天凤元年(公元14年)，秣陵县改称宣亭县。
西汉更始元年(公元23年)，恢复为秣陵县，属丹阳郡。
东汉问另斤供论曲树害建安十七年(212年)，孙权于楚金陵邑建石头城(今南京市清凉山石头城遗址)，改秣陵县为建业县，县治由秣陵关迁往石头城。南京民谚云:"先有秣陵，后有建业"，说的便是这段历史。
西晋太康元年(280年)，武帝司马炎废建业之名，恢复为秦汉旧称秣陵县。
西晋太康三年(282年)，分淮水北为建邺、南为秣陵。秣陵县治在迁往石头城70年后，又迁回了秣陵关(今南京市江宁区秣陵街道角买)。
东晋义熙九年候啊究律我丝(413年)，秣陵停正初少科仅太烈封老县治迁往建康城郭东南斗场柏社(今南京市主城)。
隋朝似农气货阳团奏开皇九年(589年)，秣陵县并入江宁县。
