包括各种江河、溪流、沟渠等生态系统。它的贮水量大约占内陆水体总水量的0.5%。在流水生态系统中，初级生产者为藻类构成的黏附性群落、水生植物等，另外陆地植物叶片的凋落物也是水生生态系统重要的物质和能量来源。在流水生态系统中，消费者主要是专九着浓鲜一些昆虫、无脊椎动物、两栖类以及鱼类。流水生态系统又可分为急流水与缓流水生态系统。
流水生态系统的特点是:
① 水流不停:这是流水生态系统的基本特征;
② 陆一水交换:河流的陆水连接表面的比例大，今西汽因此流水生态系统与周围的陆地环境有较多的联系，形成较为开放的生态系统，成为联系陆地和海洋生态系统的纽带;
氧气丰富:由于水经常处于流动状态，又因为水流深度小，和空气接触的面积大，致使河流中氧气较为丰富。